Nacido en Lleida en 1986 y afincado en Balaguer, Lluís Cortés desarrolló su carrera como futbolista en la UE Lleida, llegando a debutar en 2ª División A. Tras jugar en varios equipos de la zona, se retiró en 2011 para centrarse en la dirección técnica.

Inició su trayectoria como entrenador en el fútbol base de la UE Lleida, donde también fue segundo entrenador del primer equipo femenino. Posteriormente, dirigió y coordinó el CF Balaguer y asumió la dirección de las selecciones catalanas sub12, sub16 y sub18, logrando el Campeonato de España. En la FCF, también fue entrenador asistente de la selección catalana absoluta, seleccionador sub16 masculino (Campeón de España) y profesor de la Escuela de Entrenadores.

En 2017 se incorporó al FC Barcelona femenino como analista, pasando a entrenador asistente y, en 2019, a primer entrenador. Bajo su liderazgo, el equipo alcanzó la final de la UEFA Champions League y conquistó la Liga, Copa de la Reina, Supercopa de España y la UEFA Women’s Champions League, logrando el primer triplete de la historia del fútbol femenino español.

En noviembre de 2021 fue nombrado seleccionador nacional de Ucrania y responsable del desarrollo del fútbol femenino en el país, cumpliendo su contrato hasta agosto de 2023 pese a la difícil situación geopolítica.

Desde diciembre de 2023, lidera la selección nacional femenina de Arabia Saudí, participando en uno de los proyectos más ambiciosos del fútbol femenino mundial.